Resultierend aus seiner Unterrichtstätigkeit etablierte Günther Kaunzinger
eine Reihe von Meisterkursen (Würzburg, St. Blasien, Waldsassen), die schließlich in den
"Memminger Meisterkursen für Orgelinterpretation" ein neues Domizil fanden und
alljährlich im September für Studierende und Interessenten verschiedenster Nationalität stattfinden.